Die Arbeitsgemeinschaften an der Lippetalschule sind unterteilt nach Jahrgängen. Sie sind freiwillig und von den Schülerinnen und Schülern wählbar für ein halbes Jahr. Für die Jahrgänge 5 und 6 finden die AGs montags, für die Jahrgänge 7 und 8 donnerstags und für die Jahrgänge 9 und 10 mittwochs jeweils in der letzten Stunde statt.